Mandado construir pelo Bispo Conde D. Miguel da Anunciação, as obras iniciaram com dinheiro proveniente da sua fortuna pessoal.

O projeto, de traço e gosto italiano, é da autoria do arquiteto italiano Giovani Tamossi que, após a sua trágica morte provocada pela queda de um andaime ao colocar os sinos numa das torres, viria a ser substituído pelo cenógrafo e pintor Giacomo Azzolini, que com ele viera de Itália.

A primeira pedra foi lançada a 16 de julho de 1748, dez anos depois recebia os primeiros alunos, e foi solenemente inaugurado, após conclusão das obras, a 28 de outubro de 1765.

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Até 2012, era aqui que tinha lugar a formação eclesiástica, ao longo dos 6 anos do curso de Teologia, dos candidatos ao sacerdócio da Diocese de Coimbra, e também de outras Dioceses, nomeadamente Aveiro, Leiria, Portalegre-Castelo Branco, Cabo Verde, Beja, Macau. O Curso constava de 2 ciclos (Filosófico/Humanístico, 2 anos e Teológico/Pastoral, 4 anos), durante os quais os candidatos recebiam os ministérios de Leitor e Acólito e, posteriormente, as ordens de Diácono e Presbítero (Padre).

Atravesse o magnífico portão de bronze e poderá vislumbrar a Casa Nova e a Casa Novíssima, e o átrio que dá acesso à igreja onde se encontra um impressionante orgão de tubos e várias esculturas em madeira.

Dirija-se agora à biblioteca, um dos espaços mais impressionantes do Seminário. Aqui encontram-se guardados alguns dos livros mais importantes, protegidos com capas de cabedal e ferragens.

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Pode ainda visitar o Refeitório, as Escadas em Caracol, Capela de São Miguel, Aposentos Episcopais, Varanda do Mondego, Sala dos Azulejos (ou Sala dos Atos) e Igreja da Sagrada Família.

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